El Museo Universitario de la Biodiversidad tiene una exposición permanente de animales naturalizados, entre los que se encuentran aves, mamíferos, reptiles, peces y anfibios. Actualmente trabajamos en una exposición sobre aves del Ecuador con un enfoque especial en el orden apodiforme o de los colibríes.
Se destaca la colección de aves nativas del Ecuador entre los que se encuentran varias con importancia ecológica como cóndores y águilas. Colibríes naturalizados, tangaras guacamayas y loros acentúan por sus colores, igualmente contamos con una colección de aves nocturnas como búhos, lechuzas y chotacabras, entre otros. Por otro lado, tenemos una colección de fósiles extintos durante el Pleistoceno como Glossotherium o el perezoso gigante y restos del mastodonte. Entre los reptiles, son relevantes los caimanes, tortugas marinas, tortugas gigantes de Galápagos y una iguana marina de este mismo lugar. En la colección de peces se destaca el esturión y el tiburón blanco naturalizados. Como especies bandera se destacan el elefante africano, osos de anteojos, el puma y ocelotes. En el recorrido es posible recibir información taxonómica, ecológica y referente a la importancia de la conservación.
Está formada por aproximadamente 1722 ejemplares que se conservan como pieles (naturalizadas o de estudio), esqueletos (montados) e individuos enteros sumergidos en etanol al 70%. Existen representantes de 19 órdenes (nivel taxonómico compuesto por familias que comparten características fundamentales). Los ejemplares de esta colección proceden en su mayoría (más de un 60%) del territorio ecuatoriano, también existen ejemplares provenientes de Europa y Norteamérica que posiblemente fueron traídos por naturalistas para la fundación del “Gabinete de Zoología” para inicios del siglo XX. Su realización se debe en su mayoría a Olalla e hijos, taxidermistas que trabajaron en el Museo a principios del Siglo XX.
AVES
Se conforma por aproximadamente por 171 ejemplares que se conservan como pieles (naturalizadas o de estudio), esqueletos (montados) e individuos enteros sumergidos en etanol al 70%. Existen representantes de 11 órdenes. Los ejemplares de esta colección proceden en su mayoría del territorio ecuatoriano, también existen ejemplares provenientes de Europa y Norteamérica como el jabalí y la foca moteada.
Se conforma por aproximadamente 148 ejemplares que se conservan como pieles (naturalizadas o de estudio), esqueletos (montados) e individuos enteros sumergidos en etanol al 70%. Existen representantes de varios órdenes, familias y géneros. Los ejemplares en su totalidad proceden de territorio ecuatoriano, destacando los caimanes, iguana de galápagos y diferentes tipos de serpientes.
REPTILES
Se conforma por aproximadamente 48 ejemplares que se conservan como piel naturalizada e individuos enteros sumergidos en etanol al 70%. Existen representantes de varios órdenes. Los ejemplares en su mayor parte proceden de territorio ecuatoriano, destacando ranas coqui y sapos bufos en diferente preparación, así como un ajolote originario de México.
ANFIBIOS
MAMÍFEROS
PECES
Se conforma por aproximadamente 53 ejemplares que se conservan como piel naturalizada e individuos enteros sumergidos en etanol al 70%. Existen representantes de varios órdenes, familias y géneros. Los ejemplares en su mayor parte proceden de territorio ecuatoriano, destacando un esturión de gran tamaño, dos tiburones y el pez globo. Parte de la colección de peces corresponde a ejemplares colectados por Gustavo Orces quién desarrolló investigaciones sobre peces marinos del Ecuador.